#NEXUS 

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HPV68ME180 ATGGCATTGTGGCGCTCTAGCGACAACATGGTGTATTTGCCTCCCCCC---TCAGTGGCGAAGGTTGTCAATACAGATGATTACGTAACACGCACTGGCATTTATTACTATGCTGGTACATCTAGGTTATTAACTGTAGGCCATCCATATTTTAAGGTCCCTATGTCTGGG---------GGCCGCAAGCAGGACATTCCTAAGGTGTCTGCATATCAATACAGGGTGTTTAGGATTTCCCTACCTGATCCTAATAAATTTAGTCTTCCTGAGTCTACATTATATAACCCTGATACGCAGCGATTGGTATGGGCCTGTGTTGGTGTTGAAATAGGTAGGGGGCAGCCATTAGGTGTTGGCCTTAGTGGGCATCCATTATATAATAGGCTAGATGATACTGAAAATTCCCCGTTTTCCTCCAACAAAAATCCTAAGGACAGTAGGGACAATGTTTCAGTGGACTATAAACAAACGCAACTATGTATTATAGGCTGTGTTCCTGCCATTGGGGAGCACTGGGCCAAAGGTAAATCTTGTAAGCCTAGCAATGTGCAGCCCGGGGACTGTCCACCATTGGAATTAGTAAATACACCTATTCAGGATGGCGATATGATTGATACAGGATATGGTGCTATGGACTTTAGTACATTACAAGAAACAAAAAGCGAGGTGCCTTTAGATATATGTCAATCAGTCTGCAAATATCCTGACTATTTACAAATGTCTGCAGATGTATATGGAGACAGTATGTTCTTTTGTTTACGTAGGGAACAGTTATTTGCTAGGCATTTTTGGAATAGAGGGGGCATGGTAGGGGACACTATACCTACTGAATTGTATATTAAGGGCACTGACATA---------CGTGACAGTCCTAGTAGTTATGTATATGCCCCCTCGCCTAGTGGGTCTATGGTATCCTCAGACTCCCAGTTATTTAACAAGCCCTATTGGCTGCACAAGGCACAGGGACACAACAATGGTATTTGTTGGCATAATCAATTATTTCTTACTGTTGTGGATACCACTCGCAGTACCAATTTTACTTTGTCTACTACTACTGAATCAGCTGTA---CCAAATATTTATGATCCTAATAAATTTAAGGAATATATTAGGCATGTTGAGGAATATGATTTGCAATTTATATTTCAGTTGTGTACTATAACATTGTCCACTGATGTAATGTCCTATATACATACTATGAATCCTGCTATTTTGGATGATTGGAATTTTGGTGTTGCCCCTCCACCATCTGCTAGTCTTGTAGATACATACCGCTATCTGCAATCAGCAGCAATTACATGTCAAAAA---GACGCCCCTGCACCTACTAAAAAGGATCCATATGATGGCTTAAACTTTTGGAATGTAAATTTAAAGGAAAAGTTTAGTTCTGAACTGGACCAGTTTCCTTTAGGACGCAAATTTCTTTTACAGGCAGGTGTCCGCCGACGACCCACTATAGGCCCC---CGTAAACGCCCTGCCACAGCAACTACTGCATCTACCTCT
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HPV40      ATG------TGGCAACTTAATGAAAATCAAGTATATTTACCACCGCCAACGCCTGTTGCTACCATTGTTAGCACAGATGAGTATGTGCAACGCACCAGTTTATATTATCATGCTGGTAGTGCCAGGTTACTGACTATAGGACATCCATACTTTGAGTTAAAAAAACCC------------AATGGTGACATTTCAGTGCCTAAGGTTTCTGGACATCAATACAGGGTATTTAGGGTACGTTTGCCTGACCCGAATAAGTTTGGTTTATCTGACACCTCCTTGTTTAATTCTGAAACGCAGCGCCTTGTGTGGGCATGTGTGGGTGTGGAGGTCGGCCGTGGCCAGCCCCTAGGGGTTGGTGTTAGTGGCCATCCATACTTTAATAAGGATGAGGATGTGGAAAACTCATCTGCCTATGGCACAGGTCCGGGGCAGGATAGTAGGGAAAATGTAGCTATGGATTATAAACAGACACAGTTATGTATGTTGGGCTGCACACCCCCAATTGGGGAATATTGGGGTAAGGGCACTCCGTGCAATGCTTCTCGGGTAACCCTTGGGGACTGTCCTGTATTAGAATTAAAAACTGAGGTTATTCAGGATGGCGACATGGTGGATACTGGCTTTGGTGCTATGGATTTTGCTTCCTTGCAGGCCAATAAAAGTGATGTGCCATTGGATTTATGCACATCTATTAGTAAATATCCAGATTATTTGGGAATGGCTGCAGAACCGTATGGAAATAGTTTATTTTTTTTTCTACGCAGGGAACAAATGTTTGTTAGGCACTTTTTTAATAGGGCAGGTACTACTGGTGATAGTGTCCCAACTGACTTATATATAACAGGTACATCTGGT---------CGGACTCCTATTGCAGGCAGTATTTATTACTCCACACCAAGTGGATCCTTGGTTACCTCTGATTCTCAGATATTTAACAAGCCATTGTGGATACAAAAGGCCCAGGGCCATAACAATGGCATATGTTTTGGCAATCAGTTATTTGTTACAGTTGTAGACACCACTCGTAGCACTAATTTAACCTTATGTGCTGCCACACAGTCCCCCACA---CCAACCCCATATAATAACAGTAATTTCAAGGAATATTTGCGTCATGGGGAGGAGTTTGATTTGCAGTTTATTTTTCAGTTATGTGTAATTACCTTAAATGCAGAGGTTATGACATATATTCATGCAATGGATCCTACGTTGTTGGAGGATTGGAACTTTAAAATTGCTCCTCCAGCCTCTGCATCCTTAGAGGATACATATAGGTTCCTTACCAACAAGGCTATTGCCTGTCAGCGC---GATGCGCCCCCCAAGGTACGGGAGGATCCATATAAAAAATATAAATTTTGGGATGTCAATTTAACAGAAAGATTTTCTTCCCAATTAGATCAATTTCCATTAGGACGTAAGTTCCTTATGCAGGCTGGTGTACGTGCAGGGCCTAGGTTTAAATCC---AGGAAGCGCCCTGCCCCTTCCTCGTCTTCCTCTTCTAAG
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HPV74      ATG------TGGCGGCCTAGTGACAACCAGGTTTATGTGCCTCCTCCCGCCCCTGTATCCAAAGTCATTTCCACGGATGCCTATGTTACACGCACCAACATCTTTTATCATGCTAGCAGTTCTAGACTACTTGCTGTAGGAAATCCCTATTTTCCCATAAGGCAA---------------AGCAACAAAACAGTTGTTCCTAAGGTGTCTGGATATCAATTTAGAGTGTTTAAGGTGGTTTTGCCAGATCCCAATAAATTTGCTTTACCTGACACTTCTATATTTGACCCCTCCAGTCAACGCCTGGTATGGGCCTGTACGGGTTTGGAGGTAGGTAGGGGACAGCCTTTAGGTATTGGCATTAGTGGTCACCCTTTATTAAATAAATTAGATGATGTGGAGAATTCAGCTAGTTATGCAGCTAATCCTGGTCAGGATAACAGGGTTAATGTTGCTATGGACTATAAGCAGACACAGTTATGCATGGTAGGCTGTGCTCCCCCGTTAGGTGAACACTGGGGAAAAGGCAAGCAATGTTCTAATGTTAATGTAAAACCAGGCGATTGCCCTGCATTAGAATTAATTACTAGTGTAATTCAGGATGGTGATATGGTAGATACAGGCTTTGGTGCCATGAATTTTGCTGACTTGCAGCCTATTAAATCTGATGTTCCATTGGACATATGCAACACTACATGCAAATATCCTGATTATTTACAAATGGCTGCGGATCCATATGGTGATAGATTGTTTTTTTACTTACGCAAGGAACAAATGTTTGCAAGACACTTTTTTAATAGGGCTGGAACAGTGGGTGAGGACATTCCCCAGGACCTATATATTAAAGGTACTACA------------CGCAGTACGCTTGCCAATGCTATTTATTTTAATACTCCCAGTGGCTCTCTTGTATCTTCTGAAACACAGTTGTTTAATAAGCCGTTTTGGCTGCAAAGGGCGCAAGGCCACAATAATGGTATTTGTTGGGGTAATCAATTATTTGTTACAGTTGTGGATACCACACGCAGTACTAACATGACTGTGTGTGCTCCTACCTCACAATCGCCT---TCTGCTACATATAATAGTTCAGACTACAAACAATACATGCGACATGTGGAGGAATTTGATTTGCAATTTATTTTTCAATTATGTAGTATTAAGTTAACTGCTGAGGTTATGGCCTATATTCATACTATGAATCCTACAGTTTTAGAAGAGTGGAACTTTGGGCTAACGCCTCCCCCCAATGGTACTTTAGAAGACACCTACAGATATGTGCAGTCCCAGGCTATTACATGTCAAAAA---CCTACGCCTGATAAAGCAAAGCCCAATCCCTATGCAAATTTAAGTTTTTGGGAAGTTAATCTTAAGGAAAAGTTTTCTAGTGAATTAGATCAATACCCCCTTGGTAGAAAGTTTTTATTGCAGACAGGCGTGCAGGCACGCTCTTCCGTTCGTGTAAGTAAAAAACGGTCGGCCCCTACAGCCCCCTCCTCAGCCACT
PCPV1      ATG------TGGCGGCCTAGTGACAACAAACTATATGTGCCTCCTCCCGCCCCTGTATCAAAAGTAATTACTACGGATGCATATGTTACACGTACAAAAATATTTTATCATGCTAGCAGTTCTAGACTACTTGCAGTTGGTAATCCCTATTTTCCTATTAGAAAG---------------GGTAACAAAACTATTGTTCCCAAGGTATCTGGATTTCAGTTTAGAGTATTTAAAATAGTATTACCTGACCCTAATAAATTTGCTTTGCCTGACACATCTATATTTGATTCTACTAGTCAACGTTTGGTGTGGGCCTGTATAGGTTTAGAGGTAGGTAGGGGTCAGCCATTAGGTGTTGGTATTAGTGGACATCCTTTGTTAAACAAATTTGATGATGTAGAAAATTCTGCTAGTTATGCTGTAAACCCTGGCCAGGATAATAGGGTTAATGTAGCAATGGACTATAAACAAACACAGTTATGTTTGGTAGGTTGTGCACCTCCTTTAGGGGAACATTGGGGTAAAGGCACACAATGTTCAGGTGTAAGTGTACAAGATGGCGATTGTCCTCCATTGGAATTAGTTACTAGTGTAATTCAGGATGGTGATATGGTTGATACAGGCTTTGGAGCCATGGATTTTGCACAATTACAATCTAATAAATCAGATGTACCTTTAGATATATGCACAGCTACTTGCAAATATCCTGACTATTTACAAATGGCTGCAGATCCTTATGGTGACAGATTATTTTTTTCTTTACGTAAAGAACAAATGTTTGCAAGACATTTTTTTAATAGGGCAGGGACTGTTGGTGAGCAAATACCAGAAGACTTATTGGTTAAAGGGACTACCTCA---------CGAGCTACTGTTTCTAGTACTATTTATTTTAATACTCCCAGTGGCTCTCTTGTGTCTTCTGAAGCTCAGTTGTTTAATAAACCTTATTGGTTACATAAGGCTCAGGGACACAATAATGGCATATGTTGGGGCAATACTTTGTTTGTTACTGTTGTAGATACTACACGAAGTACAAACATGACTGTTTGTGCTTCCACAACATCGTCGCCT---TCTGCCACATACACAGCTTCAGAATATAAACAATACATGCGACATGTGGAAGAATTTGATTTGCAATTTATTTTTCAATTATGCAGTATTAAATTAACTGCTGAAGTAATGGCATATATTCATACTATGAATCCTACAGTTTTAGAAGAATGGAACTTTGGATTATCTCCCCCTCCCAATGGAACATTAGAAGACACATATAGATATGTTCAGTCTCAGGCTATAACATGTCAAAAA---CCTACTCCTGATAAGGAGAAACAGGATCCTTATGCAGGTCTCAGTTTTTGGGAAGTTAATCTTAAAGAAAAGTTTTCTAGTGAGCTAGATCAATATCCGCTTGGTAGAAAGTTTTTATTACAAACAGGCGTTCAAACTACATCCTTTGCTCGTGCAGGAACAAAACGTGCTGCAAGTACATCTTCATCTACACCTACT
HPV34      ATG------TGGCGACCTACTGAGGCAAAGGTATACCTGCCCCCTGTG---TCTGTATCTAAAGTTGTAAGCACTGAAGAGTATGTAACACGCACAAATATATATTATTATGCAGGTAGTACACGCTTGCTGGCAGTAGGACATCCCTATTATCCTATAAAGGATACTAATGGG------AAACGTAAGATTGCTGTACCTAAAGTTTCAGGTTTGCAATACAGGGTATTTAGAATACGTTTGCCAGATCCCAATAAATTTGGGTTCCCAGATGCATCTTTTTATAATCCTGACAAGGAGCGGTTGGTTTGGGCCTGTGCAGGCGTTGAGGTTGGACGCGGACAGCCATTAGGTATAGGTACTAGTGGTAATCCTTTTATGAATAAACTTGAGGATACTGAAAATGCTGCAAAATATATTGGTGGAAACATAGCAGATAGTAGGGAGTGTATGTCAGTAGATTATAAACAAACACAGTTATGTATTGTAGGCTGTAAGCCTCCCTTAGGGGAACATTGGGGTACAGGCACACCATGTGGTACCCAAAAT------GCTGGGGAATGTCCTCCGCTTGAATTAAAGAACACCACTATACAGGATGGTGATATGATTGATGTGGGCTTTGGTGCCATGGATTTTAAGGCCTTACAGGCAAATAAAAGTGATGTGCCCATTGATATTTCCAACACTATATGTAAATATCCAGATTATCTAGGCATGGCCGCAGATCCCTATGGCGATTCTATGTGGTTTTATATTCGTAGGGAACAAATGTTTGTTAGACACCTATTTAACAGGGCAGGTACTGTAGGCGATGCTATTCCAGATGACTTAATGATTAAGGGTACAGGCAAT---------ACTGCATCGCCATCCAGTTGTGTGTTTTATCCTACTCCTAGTGGGTCTATGGTATCCTCAGATGCACAAATTTTTAATAAGCCTTATTGGTTGCAAAAGGCCCAGGGACAAAACAATGGCATTTGCTGGCATAATCAACTGTTTTTAACTGTTGTAGATACTACTAGAAGCACAAACTTTTCAGTTTGTGTAGGTACACAATCCACAAGTACAACTGCACCATATGCAAACAGTAATTTTAAGGAATACCTCAGACATGCAGAAGAGTATGACCTGCAGTTTGTGTTTCAGTTATGCAAAATCAATTTAACTACAGATGTAATGACATATATACATTCTATGAGTTCTAGTATATTGGAACAGTGGAATTTTGGTCTTACACCACCGCCTTCAGGTACTTTAGAAGAAACATATAGATATGTTACTTCACAGGCCATTACATGTCAGCGT---CCGCAACCTCCTAAGGAAACAGAGGACCCATATGGTAAAATGACATTTTGGGAGGTAGACCTTAAAGAAAAATTTTCTGCAGAATTAGATCAGTTTGCCTTAGGTAGAAAGTTTTTATTACAACTAGGTATGCGTGCCCGTCCTAGGTTACAGGCC---TCTAAACGGTCTGCACCTTCATCATCTAGTACAGCACCT
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